La UNIPA se creó en el Primer Encuentro Binacional que se realizó en la Reserva Natural La Planada el 6 de junio de 1990, con el nombre de Unidad Indígena del Proyecto Awá; más adelante en la Segunda Reunión Binacional en la comunidad de Alto Albí en el año de 1991, decidimos cambiar la palabra "proyecto" por "pueblo". Se conformó la Comisión de Educación Bilingüe e Intercultural Awá, hoy Programa de Educación Awá, reconocido por la Secretaria de Educación Departamental.

Inicialmente en nuestro territorio no existían escuelas Awá ni profesores indígenas; a raíz de la creación de la Organización, los mayores y autoridades vieron la necesidad de la educación de los niños y jóvenes. Antes no sabíamos donde pedir escuelas y profesores; algunas familias que tenían recursos, mandaban a los hijos a estudiar al pueblo y otros los llevaban los padrinos o aprendían cuando salían a trabajar por esfuerzos propios. Esa forma de educación llevaba a la pérdida de la identidad cultural, el idioma awapit y las costumbres propias porque la gente no indígena se burlaba de nuestra forma de ser, pensar, hablar y de vestir.

Se dio inicio con pocas escuelas y con profesores no indígenas. Hoy en día contamos con 68 Centros Educativos y 100 educadores Awá y no Awá. Nuestros Centros Educativos son dispersos a 3, 4, 8 horas y hasta un día de camino. Para llegar ellos hay que cruzar quebradas y ríos.

En Ecuador ya venían realizando cursos de nivelación de la básica primara en los que participaron un grupo de jóvenes Awá de Colombia de diferentes resguardos y comunidades; también se trabajó conjuntamente en la lingüística del awapit como fundamento de la unificación del alfabeto awapit, la cultura e identidad del pueblo Awá durante los años de 1988 a 1993.

Luego se vio la necesidad de publicar materiales didácticos y se han elaborado y publicado cartillas Sajkit Kamna = aprender jugando en el año 1991 y cartilla de lecto-escritura awapit Pakamna = aprender a escribir en idioma indígena Awápit en el año 2001. Y cartilla de lectoescritura de 2° Grado Awapit Patkit Parakamna = Aprender el idioma Awapit escribiendo.

El Proyecto Educativo Awá, es el resultado del trabajo desarrollado, no es definitivo, es dinámico y contempla las generalidades de la educación Awá, como proyecto cultural y las particularidades de cada escuela como proyecto institucional

La educación Awá se profundiza en conocimientos y prácticas de acuerdo a la asunción de otras responsabilidades como integrante de la comunidad, en este ejercicio se tratan aspectos como: Legislación Indígena y Constitución Política de Colombia, gobierno, salud, comercio y economía, medio ambiente, autonomía, jurisdicción, relaciones con entidades municipales, departamentales y nacionales, origen del Awá, cosmovisión, ritos y curaciones.

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